Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMF1P82094 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMF1P82094 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMF1P82094 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMF1P82094 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMF1P82094 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMF1P82094 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMF1P82094 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMF1P82094 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMF1P82094 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMF1P82094 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMF1P82094 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMF1P82094 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMF1P82094 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMF1P82094 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMF1P82094 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMF1P82094 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMF1P82094 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMF1P82094 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMF1P82094 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMF1P82094 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMF1P82094 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMF1P82094 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMF1P82094 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMF1P82094 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMF1P82094 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms