Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-24P63145 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK-24P63145 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms