Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC1P62191 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC1P62191 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC1P62191 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms