Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS2P61201 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS2P61201 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPS2P61201 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPS2P61201 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPS2P61201 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPS2P61201 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS2P61201 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS2P61201 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS2P61201 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS2P61201 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS2P61201 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS2P61201 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS2P61201 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS2P61201 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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