Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP11P59045 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP11P59045 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms