Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00310P59036 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00310P59036 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00310P59036 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00310P59036 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00310P59036 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00310P59036 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00310P59036 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00310P59036 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00310P59036 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00310P59036 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00310P59036 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms