Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL3P58872 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms