Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MTCP1P56278 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MTCP1P56278 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms