Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP1P56182 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP1P56182 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP1P56182 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1P56182 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RRP1P56182 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RRP1P56182 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RRP1P56182 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1P56182 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1P56182 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1P56182 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1P56182 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1P56182 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1P56182 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1P56182 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1P56182 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1P56182 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1P56182 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1P56182 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1P56182 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1P56182 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms