Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELLP55199 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELLP55199 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms