Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMTNP53814 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMTNP53814 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMTNP53814 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNP53814 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNP53814 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms