Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACLYP53396 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACLYP53396 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACLYP53396 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACLYP53396 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACLYP53396 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms