Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms