Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms