Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms