Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK8P49336 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK8P49336 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK8P49336 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK8P49336 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK8P49336 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms