Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX5P48382 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX5P48382 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX5P48382 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX5P48382 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX5P48382 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX5P48382 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX5P48382 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX5P48382 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX5P48382 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX5P48382 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX5P48382 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX5P48382 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX5P48382 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX5P48382 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX5P48382 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX5P48382 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX5P48382 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX5P48382 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX5P48382 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX5P48382 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX5P48382 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX5P48382 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX5P48382 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX5P48382 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms