Protein–RNA interactions for Protein: P47044

YJL055W, LOG family protein YJL055W, yeastyeast

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL055WP47044 CBF2YGR140W 2871 nt2.53□□□□□ -2
YJL055WP47044 TCB2YNL087W 3537 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 MES1YGR264C 2256 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 PBP4YDL053C 558 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YIP1YGR172C 747 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 KTI11YBL071W-A 249 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 HOS4YIL112W 3252 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 SCP160YJL080C 3669 nt2.52□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 INP53YOR109W 3324 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 SPF1YEL031W 3648 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YDR203WYDR203W 318 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 PRE1YER012W 597 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YGR293CYGR293C 462 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 SMA2YML066C 1110 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 MIX23YBL107C 591 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 CAT5YOR125C 702 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 ATP20YPR020W 348 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 SIR4YDR227W 4077 nt2.51□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YOR296WYOR296W 3870 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 PRP6YBR055C 2700 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YGR242WYGR242W 309 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 SPO11YHL022C 1197 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YMR187CYMR187C 1296 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YOR169CYOR169C 465 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 ARR2YPR200C 393 nt2.5□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YRB1YDR002W 606 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 SDC1YDR469W 528 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 JIP3YLR331C 378 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 HSC82YMR186W 2118 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 RPL25YOL127W 429 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 JID1YPR061C 906 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YCL002CYCL002C 792 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 NCS2YNL119W 1482 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YEL043WYEL043W 2871 nt2.49□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 PSK2YOL045W 3306 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YCL020WYCL020W 1317 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 PGD1YGL025C 1194 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 TWF1YGR080W 999 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 COG2YGR120C 789 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 MED8YBR193C 672 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 BNR1YIL159W 4128 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YPR097WYPR097W 3222 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 KAR9YPL269W 1935 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YRR1YOR162C 2433 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 GDI1YER136W 1356 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 GIN4YDR507C 3429 nt2.48□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YCR099CYCR099C 468 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YCR108CYCR108C 192 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YDR248CYDR248C 582 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 HMF1YER057C 390 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 ACB1YGR037C 264 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 YIL082WYIL082W 873 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 SDS22YKL193C 1017 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 COA4YLR218C 453 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 ATP3YBR039W 936 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 SNF12YNR023W 1701 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 ARP8YOR141C 2646 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 SEC26YDR238C 2922 nt2.47□□□□□ -2.01
YJL055WP47044 RSM18YER050C 417 nt2.46□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 MRM2YGL136C 963 nt2.46□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 PEX18YHR160C 852 nt2.46□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 UBC12YLR306W 567 nt2.46□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YNR021WYNR021W 1215 nt2.46□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 PSO2YMR137C 1986 nt2.46□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YKL075CYKL075C 1353 nt2.46□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YDR186CYDR186C 2634 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 snR59snR59 78 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 RIM9YMR063W 720 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 SAS2YMR127C 1017 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YMR320WYMR320W 306 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YOL150CYOL150C 312 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YBR197CYBR197C 654 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YPR089WYPR089W 2667 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 SHE4YOR035C 2370 nt2.45□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 RPN3YER021W 1572 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 VPS13YLL040C 9435 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 PHO91YNR013C 2685 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 ERP6YGL002W 651 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 PAU23YLR037C 375 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 COX14YML129C 213 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 RPS12YOR369C 432 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 TRM7YBR061C 933 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 NSL1YPL233W 651 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YPR170CYPR170C 336 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 SVL3YPL032C 2478 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YOL098CYOL098C 3114 nt2.44□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 PRK1YIL095W 2433 nt2.43□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 YDR115WYDR115W 318 nt2.43□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 PET191YJR034W 327 nt2.43□□□□□ -2.02
YJL055WP47044 ACF4YJR083C 930 nt2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.2 ms