Protein–RNA interactions for Protein: P38148

PPS1, Dual specificity protein phosphatase PPS1, yeastyeast

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPS1P38148 VTI1YMR197C 654 nt3.49□□□□□ -1.85
PPS1P38148 snR42snR42 351 nt3.49□□□□□ -1.85
PPS1P38148 MIT1YEL007W 2001 nt3.49□□□□□ -1.85
PPS1P38148 PIN4YBL051C 2007 nt3.49□□□□□ -1.85
PPS1P38148 GCN1YGL195W 8019 nt3.48□□□□□ -1.85
PPS1P38148 MAK5YBR142W 2322 nt3.48□□□□□ -1.85
PPS1P38148 POL4YCR014C 1749 nt3.48□□□□□ -1.85
PPS1P38148 SNA4YDL123W 423 nt3.48□□□□□ -1.85
PPS1P38148 YGR025WYGR025W 303 nt3.48□□□□□ -1.85
PPS1P38148 YGR053CYGR053C 852 nt3.48□□□□□ -1.85
PPS1P38148 COX23YHR116W 456 nt3.48□□□□□ -1.85
PPS1P38148 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.48□□□□□ -1.85
PPS1P38148 OST2YOR103C 393 nt3.48□□□□□ -1.85
PPS1P38148 STE6YKL209C 3873 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 YMR317WYMR317W 3423 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 SLM2YNL047C 1971 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 YHR080CYHR080C 4038 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 PCK1YKR097W 1650 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 ROY1YMR258C 1662 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 RPS29BYDL061C 171 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 YGL165CYGL165C 579 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 RPL19BYBL027W 570 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 MRPL50YNR022C 420 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 ATP3YBR039W 936 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 PIS1YPR113W 663 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 DNM1YLL001W 2274 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 VAC14YLR386W 2643 nt3.47□□□□□ -1.85
PPS1P38148 YEL075CYEL075C 369 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 CDC26YFR036W 375 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YAR070CYAR070C 300 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 CWC24YLR323C 780 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 UBC7YMR022W 498 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YMR320WYMR320W 306 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 TSC3YBR058C-A 243 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 PEX1YKL197C 3132 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YDR338CYDR338C 2088 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 KAP95YLR347C 2586 nt3.46□□□□□ -1.86
PPS1P38148 EBS1YDR206W 2655 nt3.45□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YDL068WYDL068W 330 nt3.45□□□□□ -1.86
PPS1P38148 GCN4YEL009C 846 nt3.45□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YGR073CYGR073C 372 nt3.45□□□□□ -1.86
PPS1P38148 PEX17YNL214W 600 nt3.45□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.45□□□□□ -1.86
PPS1P38148 ZDS2YML109W 2829 nt3.45□□□□□ -1.86
PPS1P38148 MET10YFR030W 3108 nt3.45□□□□□ -1.86
PPS1P38148 BEM4YPL161C 1902 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 NSP1YJL041W 2472 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 SKN7YHR206W 1869 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 RNH70YGR276C 1662 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YJR003CYJR003C 1560 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YFR054CYFR054C 579 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 HHF2YNL030W 312 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 UTP13YLR222C 2454 nt3.44□□□□□ -1.86
PPS1P38148 CAF130YGR134W 3369 nt3.43□□□□□ -1.86
PPS1P38148 PWP2YCR057C 2772 nt3.43□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YGL042CYGL042C 306 nt3.43□□□□□ -1.86
PPS1P38148 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt3.43□□□□□ -1.86
PPS1P38148 LAG1YHL003C 1236 nt3.43□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt3.43□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt3.43□□□□□ -1.86
PPS1P38148 ARO1YDR127W 4767 nt3.43□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YPS6YIR039C 1614 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YCK2YNL154C 1641 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 PRM15YMR278W 1869 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 HTA1YDR225W 399 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 JLP2YMR132C 627 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YOL114CYOL114C 609 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YPL276WYPL276W 438 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 TIF4631YGR162W 2859 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 ICR1ICR1 3199 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 CEP3YMR168C 1827 nt3.42□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YDR102CYDR102C 333 nt3.41□□□□□ -1.86
PPS1P38148 RPS18AYDR450W 441 nt3.41□□□□□ -1.86
PPS1P38148 GRX2YDR513W 432 nt3.41□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YFL032WYFL032W 321 nt3.41□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YGR242WYGR242W 309 nt3.41□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.41□□□□□ -1.86
PPS1P38148 NTO1YPR031W 2247 nt3.41□□□□□ -1.86
PPS1P38148 SEA4YBL104C 3117 nt3.41□□□□□ -1.86
PPS1P38148 SRC1YML034W 2505 nt3.4□□□□□ -1.86
PPS1P38148 HOP1YIL072W 1818 nt3.4□□□□□ -1.86
PPS1P38148 YDR442WYDR442W 393 nt3.4□□□□□ -1.87
PPS1P38148 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.4□□□□□ -1.87
PPS1P38148 VEL1YGL258W 621 nt3.4□□□□□ -1.87
PPS1P38148 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.4□□□□□ -1.87
PPS1P38148 RPL39YJL189W 156 nt3.4□□□□□ -1.87
PPS1P38148 YJR111CYJR111C 852 nt3.4□□□□□ -1.87
PPS1P38148 MYO3YKL129C 3819 nt3.4□□□□□ -1.87
PPS1P38148 HEF3YNL014W 3135 nt3.4□□□□□ -1.87
PPS1P38148 YJR030CYJR030C 2238 nt3.4□□□□□ -1.87
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