Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH11P35749 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH11P35749 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH11P35749 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH11P35749 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH11P35749 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH11P35749 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH11P35749 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH11P35749 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH11P35749 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH11P35749 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH11P35749 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH11P35749 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH11P35749 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYH11P35749 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYH11P35749 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms