Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKARP32238 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKARP32238 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKARP32238 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKARP32238 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKARP32238 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKARP32238 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms