Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPS1P31327 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPS1P31327 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPS1P31327 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPS1P31327 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CPS1P31327 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPS1P31327 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPS1P31327 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPS1P31327 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPS1P31327 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPS1P31327 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPS1P31327 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPS1P31327 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPS1P31327 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPS1P31327 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPS1P31327 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPS1P31327 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPS1P31327 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPS1P31327 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPS1P31327 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPS1P31327 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPS1P31327 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPS1P31327 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPS1P31327 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPS1P31327 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CPS1P31327 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPS1P31327 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CPS1P31327 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CPS1P31327 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CPS1P31327 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CPS1P31327 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPS1P31327 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPS1P31327 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPS1P31327 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPS1P31327 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPS1P31327 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CPS1P31327 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPS1P31327 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPS1P31327 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPS1P31327 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPS1P31327 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms