Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms