Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms