Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECHS1P30084 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms