Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA1P29973 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CNGA1P29973 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA1P29973 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms