Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK3P27448 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARK3P27448 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARK3P27448 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARK3P27448 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms