Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCM3P25205 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MCM3P25205 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCM3P25205 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCM3P25205 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCM3P25205 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms