Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT1P21579 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYT1P21579 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYT1P21579 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYT1P21579 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYT1P21579 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT1P21579 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT1P21579 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT1P21579 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms