Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDCP19113 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDCP19113 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDCP19113 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDCP19113 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDCP19113 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDCP19113 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDCP19113 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDCP19113 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDCP19113 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDCP19113 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDCP19113 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms