Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms