Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC130P13994 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC130P13994 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms