Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT1P13805 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms