Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XRCC5P13010 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC5P13010 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms