Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BMP3P12645 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BMP3P12645 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BMP3P12645 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
BMP3P12645 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BMP3P12645 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP3P12645 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP3P12645 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP3P12645 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP3P12645 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP3P12645 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP3P12645 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms