Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT3P12035 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT3P12035 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KRT3P12035 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT3P12035 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT3P12035 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT3P12035 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT3P12035 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms