Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODC1P11926 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODC1P11926 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ODC1P11926 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ODC1P11926 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ODC1P11926 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODC1P11926 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODC1P11926 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODC1P11926 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms