Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms