Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD1P0DJD0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD1P0DJD0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms