Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSN3P07498 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSN3P07498 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSN3P07498 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSN3P07498 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms