Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTMAP06454 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTMAP06454 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTMAP06454 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTMAP06454 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTMAP06454 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTMAP06454 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTMAP06454 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTMAP06454 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTMAP06454 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTMAP06454 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms