Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDN1P05305 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDN1P05305 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDN1P05305 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDN1P05305 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDN1P05305 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDN1P05305 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDN1P05305 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDN1P05305 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDN1P05305 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EDN1P05305 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDN1P05305 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDN1P05305 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDN1P05305 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDN1P05305 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDN1P05305 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDN1P05305 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDN1P05305 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDN1P05305 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDN1P05305 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDN1P05305 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms