Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCCAP05165 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCCAP05165 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCCAP05165 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCCAP05165 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCCAP05165 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCCAP05165 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCCAP05165 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCCAP05165 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCCAP05165 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCCAP05165 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCCAP05165 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCCAP05165 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCCAP05165 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCCAP05165 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCCAP05165 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCCAP05165 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCCAP05165 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCCAP05165 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCCAP05165 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCCAP05165 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCCAP05165 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCCAP05165 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms