Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD4O95243 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD4O95243 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD4O95243 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD4O95243 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD4O95243 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD4O95243 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD4O95243 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD4O95243 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD4O95243 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD4O95243 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD4O95243 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD4O95243 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD4O95243 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD4O95243 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD4O95243 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD4O95243 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD4O95243 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD4O95243 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD4O95243 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD4O95243 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD4O95243 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD4O95243 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD4O95243 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD4O95243 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD4O95243 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD4O95243 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms