Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRPM2O94759 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRPM2O94759 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms