Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN5O75503 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN5O75503 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLN5O75503 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLN5O75503 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN5O75503 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN5O75503 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN5O75503 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms