Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAB2O43741 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms