Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCP110O43303 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCP110O43303 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCP110O43303 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCP110O43303 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCP110O43303 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms