Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APAF1O14727 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APAF1O14727 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APAF1O14727 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APAF1O14727 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APAF1O14727 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APAF1O14727 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms