Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXLO00592 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXLO00592 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXLO00592 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXLO00592 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXLO00592 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXLO00592 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXLO00592 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PODXLO00592 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PODXLO00592 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PODXLO00592 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms